土培條件下，淹水會(huì)使土壤通氣性下降，根際氧含量降低，土壤氧化還原電位過低。土壤氧化還原電位太低，土壤有機(jī)質(zhì)分解變慢養(yǎng)分供應(yīng)能力會(huì)下降，嫌氣分解產(chǎn)生大量有機(jī)酸會(huì)抑制根系呼吸作用。土壤長期的低氧化還原電位還會(huì)使Fe、Mn有效性增加造成根系毒害，硫化氫和丁酸積累也會(huì)抑制根系生長。根系長期生長受抑制，長期被毒物毒害，就會(huì)造成細(xì)胞壞死、凋亡，呈現(xiàn)出黑褐色的爛根癥狀，俗稱淹水漚爛。
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水培條件下，營養(yǎng)液的成分通常簡單，沒有過多復(fù)雜的土壤有機(jī)物，只有必須的大量、中微量礦質(zhì)營養(yǎng)。而且水培是要換水的！水培通常三到五天就要換一次水，不然水會(huì)臭，會(huì)有藻類和其他微生物滋長。因此，正規(guī)的水培條件下來不及積累大量的硫化氫等有害物質(zhì)，水有一定的氧溶解量，通過換水可以供應(yīng)植物根系需要的氧氣。
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另外，土壤的成土母質(zhì)成分并不單一，不同母質(zhì)差別大，但淹水都會(huì)使土壤中的次生黏土礦物中Fe、Mn有效性升高甚至過量造成毒性增強(qiáng)，水培條件下的培養(yǎng)液不含鎘、砷、鋁等毒物，F(xiàn)e、Mn、Cu、Zn等微涼元素的含量也控制在適宜水平遠(yuǎn)不會(huì)因?yàn)榄h(huán)境變化造成過量或毒害。
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